Ռազմական հակահետախուզությունն ազգային անվտանգության մարմինների իրավասության սահմաններում իրականացվող գործառույթ է՝ ուղղված ՀՀ զինված ուժերի և այլ զինվորական կառույցների նկատմամբ օտարերկրյա պետությունների հատուկ ծառայությունների և այլ կազմակերպությունների, ինչպես նաև առանձին անձանց հետախուզական գործունեության բացահայտմանը, կանխմանը և խափանմանը: Ռազմական հակահետախուզությունն ազգային անվտանգության մարմինների գործունեության հիմնական ուղղություններից մեկն է: «Ազգային անվտանգության մարմինների մասին» ՀՀ օրենքի համաձայն՝ «Ռազմական հակահետախուզական գործունեությունը լիազորված մարմնի ռազմական հակահետախուզական մարմնի (ծառայությունների, բաժինների, բաժանմունքների) կողմից իրականացվում է Հայաստանի Հանրապետության զինված ուժերում, Հայաստանի Հանրապետության ոստիկանության զորքերում, այլ զորքերում և զինվորական կազմավորումներում, ինչպես նաև դրանց կառավարման մարմիններում՝ հանցագործությունները բացահայտելու, կանխելու և խափանելու, օտարերկրյա պետությունների հատուկ ծառայությունների ներթափանցումից պաշտպանելու, ինչպես նաև մարտունակությունը և մարտական պատրաստությունը պահպանելիս հրամանատարությանն աջակցելու նպատակով»:
ՀՀ ԱԱԾ ՌՀՀ մարմիններն իրենց գործունեության ընթացքում ղեկավարվում են ՀՀ Սահմանադրությամբ, «Ազգային անվտանգության մարմինների մասին», «Օպերատիվ-հետախուզական գործունեության մասին», «Պետական գաղտնիքի մասին» և այլ օրենքներով, ինչպես նաև ՀՀ ԱԱԾ իրավական ակտերով և ռազմական հակահետախուզության կանոնադրությամբ։
Ռազմական հակահետախուզության մարմինները՝ ՀՀ շուրջ ստեղծված աշխարհաքաղաքական և տարածաշրջանային բարդ իրավիճակում հաջողությամբ իրականացնում են իրենց գործառույթները՝ վերապահված տեղամասերում բացահայտելով օտարերկրյա հատուկ ծառայությունների գործակալներ ու լրտեսներ, բազմաթիվ դեպքերով կանխել ու խափանել են Հայաստանի Հանրապետության, նրա զինված ուժերի դեմ օտարերկրյա հատուկ ծառայությունների, կազմակերպությունների և առանձին անձանց հետախուզական քայքայիչ գործունեությունը։
Ռազմական հակահետախուզության ստորաբաժանումները հսկողություն են սահմանում նաև ՀՀ զինված ուժերում պետական գաղտնիքի պահպանման գործընթացի նկատմամբ՝ բացահայտելով ու կանխելով գաղտնիքների հնարավոր արտահոսքի ուղիները։
Ռազմական հակահետախուզությունը՝ որպես ԱԱԾ առանձին մարմին, իր գործունեությունը ծավալում է 1995 թվականից և այդ ժամանակահատվածից սկսած ներգրավված է ՀՀ ԶՈՒ համակարգի մարտունակությանը և մարտական պատրաստականությանը խոչընդոտող երևույթների վեր հանմանն ու հրամանատարությանն աջակցելու գործընթացում՝ այդ ընթացքում բացահայտելով ՀՀ ազգային անվտանգությանը սպառնացող բազմաթիվ դեպքեր։